北京化工大学教授冯越课题组与加州大学旧金山分校教授Joseph Bondy-Denomy课题组协作,证明晰现在已知的仅有的三种海绵蛋白——Acb2、Tad1、Tad2均为具有多个结合位点阻隔信号分子的“超级海绵”,这一发现暗示具有多个信号分子结合位点的反防护蛋白或许广泛存在,然后建立了噬菌体反防护“海绵蛋白”研讨的新范式。10月30日,相关研讨成果在线发表于《天然》。
在微生物的国际里,细菌和噬菌体之间的奋斗犹如一场没有硝烟的“军备竞赛”。细菌“道高一尺”,建立了多种抗噬菌体防护体系来抵挡噬菌体侵略。而面临细菌的防护手法,噬菌体“魔高一丈”,编码很多反防护蛋白,从不同阶段去搅扰细菌的防护体系,以此来保证自己能成功侵染细菌。
近年来,冯越课题组连续阐明晰噬菌体多种反防护蛋白以及可一起按捺CRISPR-Cas体系和CBASS体系的Acb2蛋白的按捺机制。中外课题组协作报导了Acb2这一反防护蛋白,经过两种不同的结合口袋吸附一切现在已知的CBASS以及III型CRISPR-Cas体系的信号分子,因而称其为“超级海绵”。
为了提醒噬菌体抗Thoeris体系蛋白Tad蛋白结合信号分子的机制,冯越组解析了Tad蛋白与多种环状寡核苷酸的复合物晶体结构。他们发现Tad1蛋白以六聚体方式存在,而不是之前报导的二聚体,Tad1像一个具有两个“阻隔舱”的“分子飞船”,能构成两个独立口袋阻隔两个CTN,一起Tad1还运用与gcADPR分子相同的结合口袋阻隔CDN。而Tad2则是一个四聚体,可一起与两个CDN和两个gcADPR分子结合。
更有意思的是,他们发现Tad2的一个homolog(HgmTad2)对cGG的结合亲和力高达24pM,是现在已报导的亲和力最强的cGG结合蛋白,也远高于现在报导的海绵蛋白对信号分子的亲和力。在细菌中,cGG是最广泛的CDN,它像一个“要害纽带”参加调理细菌成长和行为包含运动、毒力、生物膜构成和细胞周期进程等多个方面。
课题组证明晰,Tad1和Tad2蛋白与Acb2均为具有两种不同的结合口袋的“超级海绵”,然后将现在发现的仅有的三个噬菌体海绵蛋白均一致为多结合口袋的“超级海绵”。